La bahía cuenta con numerosas islas e islotes como la de Grand Manan, la más grande, la isla Campobello, en la que el presidente de los Estados Unidos Frank D. Roosevelt tenía su residencia de verano, Deer o Long Island.
La popularidad de la bahía, así como su carácter más curioso, reside en sus importantes mareas, que pueden llegar a variar hasta 21 metros. Este espectacular efecto de la naturaleza envuelve la bahía con un halo de leyenda ya que se dice que estas fuertes mareas las provocan los movimientos de una ballena gigante. Desde el punto de vista científico, las variaciones se producen por los ríos que desembocan en las aguas de la bahía de manera que cuando hay marea baja, el agua de los ríos desemboca en el mar mientras que cuando la marea sube, el agua salada del mar invade las cuencas de los ríos. Fundy posee además una rica flora y fauna y un rico ecosistema marino. En los meses cálidos, aproximadamente de junio a octubre, se pueden avistar ballenas en la bahía. Es también escala en las migraciones de millones de aves por lo que los amantes de los animales tienen en esta zona el espectáculo garantizado.
